O Núcleo de Inteligência e Segurança Institucional (NIS) tem um amplo rol de atribuições referente ao planejamento, ao controle e à execução das diferentes atividades das áreas de inteligência e de segurança no âmbito do Ministério Público do Estado do Tocantins. Instituído pela Resolução n. 004/2015 do Colégio de Procuradores de Justiça, o núcleo é coordenado por membro do Ministério Público escolhido pelo procurador-geral de Justiça.